吕梁市畜牧兽医局成立于2007年5月28日，为行政机构，正处级建制。局下设12个科站，其中：行政科室5个，分别是办公室、人事科教科、计划财务科、畜牧科、兽医科；事业站所7个，分别是动物卫生监督所、动物疫病预防控制中心、畜牧技术推广站、牧草饲料工作站、畜牧兽医质量安全检验中心、离石交口动物防疫监督站、佳临大桥动物防疫监督站。

    单位主要职能：贯彻落实党和国家、省有关畜牧兽医行业的方针政策和法律法规，指导全市畜牧兽医行业结构调整，负责全市畜牧产业化的组织和实施;负责全市动物及动物产品的防疫检疫工作；负责全市兽医医政和药政管理；负责指导全市饲草饲料资源的开发，负责全市饲料及饲料添加剂的管理;负责组织全市畜禽良种繁育体系建设及种畜禽管理工作。